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2020年3月8日，安徽師范大學(xué)在bioRxiv上上傳了一篇題為Genome-widedata inferring the evolution and population demography of the novel pneumonia coronavirus (SARS-CoV-2) 的研究分析，作者使用10個(gè)新測(cè)序的SARS-CoV-2基因組，并結(jié)合GISAID數(shù)據(jù)庫(kù)中的136個(gè)基因組，通過(guò)不同的分析方法（如EBSP、錯(cuò)配和中性檢測(cè)等）研究前三個(gè)月數(shù)據(jù)的遺傳變異和統(tǒng)計(jì)。 結(jié)果顯示80個(gè)單倍型共有183個(gè)突變位點(diǎn)，包括27個(gè)簡(jiǎn)約性信息位點(diǎn)和156個(gè)單一位點(diǎn)。對(duì)遺傳多樣性的滑動(dòng)窗口分析表明，SARS-CoV-2基因組豐度的變化有一定范圍，這可以解釋目前這種病毒的廣泛和高適應(yīng)性。遺傳學(xué)分析不支持穿山甲是中間宿主。在最初的單倍型（H14）中，一個(gè)患者樣本居住在華南海鮮市場(chǎng)附近（約2公里），這表明患者有無(wú)意識(shí)接觸該市場(chǎng)史的可能性很高。然而，基于這個(gè)線(xiàn)索，也無(wú)法準(zhǔn)確斷定這個(gè)市場(chǎng)是否是SARS-CoV-2的起源中心。此外，從這個(gè)市場(chǎng)收集的16個(gè)基因組，包含10個(gè)單倍型，表明市場(chǎng)在短期內(nèi)出現(xiàn)循環(huán)感染，這可能導(dǎo)致武漢和其他地區(qū)爆發(fā)SARS-CoV-2。EBSP結(jié)果顯示，第一個(gè)估計(jì)的擴(kuò)展日期從2019年12月7日開(kāi)始，這表明SARS-CoV-2的傳染可能在11月中下旬開(kāi)始。

本發(fā)明公開(kāi)了一種小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18,所述基因包含如SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列,或包含與SEQ?ID?NO.1序列互補(bǔ)的核苷酸序列,該基因編碼CCCH型鋅指蛋白18,可作為小麥穗發(fā)芽抗感品種的分子標(biāo)記基因.該小麥抗穗發(fā)芽基因TaZFP18為一種新的小麥抗穗發(fā)芽主效基因,利用其開(kāi)發(fā)分子標(biāo)記,可以迅速鑒定小麥?zhǔn)欠駷樗氚l(fā)芽抗性品種,也為小麥穗發(fā)芽抗性育種提供了新的基因資源.

本發(fā)明涉及基因工程技術(shù)領(lǐng)域，具體公開(kāi)了VvSUC27基因(GenBank登錄號(hào)：AF021810)在促進(jìn)植物攝取外界蔗糖中的應(yīng)用以及其在促進(jìn)植物生長(zhǎng)(尤其是在弱光環(huán)境或無(wú)光環(huán)境中生長(zhǎng))中的應(yīng)用。本發(fā)明通過(guò)過(guò)表達(dá)VvSUC27基因，促進(jìn)了植物攝取外界蔗糖，同時(shí)可使轉(zhuǎn)基因植物出現(xiàn)快速生長(zhǎng)的表型，并且可以在微光甚至使無(wú)光下快速生長(zhǎng)，證實(shí)了該基因的一個(gè)新的功能應(yīng)用。VvSUC27基因的克隆和轉(zhuǎn)基因的應(yīng)用，有望應(yīng)用于肉質(zhì)根或塊根植物及花卉等植物的培育中，使得植物即使在無(wú)光下也能快速生長(zhǎng)，有利于節(jié)約光能減少能源的浪費(fèi)。

本發(fā)明涉及預(yù)測(cè)重型肝炎病情基因的甲基化狀態(tài)檢測(cè)的方法及試劑，提取病人外周血單個(gè)核細(xì)胞 DNA 進(jìn)行亞硫酸氫鹽修飾后，分別用谷胱甘 肽 S-轉(zhuǎn)移酶 M3 甲基化（M）特異性和非甲基化（U）特異性引物對(duì)進(jìn)行甲基化 特異性聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)，根據(jù)擴(kuò)增產(chǎn)物判斷其甲基化狀態(tài)，有助于臨床醫(yī)生判 定重型肝炎患者的病情和指導(dǎo)治療。

研發(fā)階段/n口蹄疫（FMD）是引起的人及偶蹄動(dòng)物共患的一種烈急性、高度接觸性、發(fā)熱性傳染病。FMD在世界上許多國(guó)家流行，造成重大的經(jīng)濟(jì)損失和政治影響。口蹄疫病毒（FMDV）屬于小RNA病毒科（Picornaviridae），口蹄疫病毒屬（Aphthovirus），該病毒為單股正鏈小RNA病毒，基因組長(zhǎng)約8500個(gè)核苷酸，主要由結(jié)構(gòu)基因（P1區(qū)）和非結(jié)構(gòu)基因（P2、P3區(qū)）等構(gòu)成。該發(fā)明具體涉及一種新的含有口蹄疫病毒主要免疫原性基因的重組偽狂犬病弱毒疫苗株，該毒株屬于豬偽狂犬病毒：Pseudorabi

研發(fā)階段/n這是免疫性狀相關(guān)基因?qū)＠ㄟ^(guò)本專(zhuān)利的應(yīng)用，在豬育種中可以提高豬的免疫力和抗病力，節(jié)約醫(yī)藥成本，提高經(jīng)濟(jì)效益。

本發(fā)明公開(kāi)了一種端粒酶啟動(dòng)基因表達(dá)方法(Telomerase?Activating gene Expression，Tage)及其應(yīng)用，該表達(dá)方法基于端粒酶可結(jié)合并延長(zhǎng)DNA分子末端的端粒酶識(shí)別序列，合成新的端粒重復(fù)序列的特性，將端粒酶特有的生物學(xué)功能與人工轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控細(xì)胞基因表達(dá)技術(shù)相結(jié)合，發(fā)展了Tage新方法。Tage技術(shù)在細(xì)胞中可以有效發(fā)生，人工轉(zhuǎn)錄因子可激活效應(yīng)基因在端粒酶陽(yáng)性細(xì)胞中的表達(dá)，效應(yīng)基因的表達(dá)產(chǎn)物可有效殺滅腫瘤細(xì)胞，本發(fā)明證明Tage技術(shù)可用于殺滅腫瘤細(xì)胞，而對(duì)無(wú)端粒酶活性的細(xì)胞

一直以來(lái)，自從第二代高通量測(cè)序技術(shù)開(kāi)發(fā)至今，基因組測(cè)序成本已經(jīng)降低到3000美元，我們馬上就要來(lái)到1000 dollar genome 的時(shí)代。然而從復(fù)雜冗余的基因序列中解讀出與疾病相關(guān)，與藥物相關(guān)的重要信息，已經(jīng)成為當(dāng)前生物信息學(xué)已經(jīng)成為生物信息學(xué)中最重要的挑戰(zhàn)。面對(duì)該挑戰(zhàn)，程容海等人開(kāi)發(fā)了一個(gè)在線(xiàn)的個(gè)人基因組解碼平臺(tái)（Virtual Pharmacist）。它可以支持分析目前主流的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)格式，并且通過(guò)該軟件后臺(tái)的數(shù)據(jù)庫(kù)和算法，挖掘出個(gè)人基因組中的基因突變（Single Nucleotide Polymorphism）與藥物反應(yīng)的關(guān)聯(lián)性分析。該平臺(tái)只需要用戶(hù)上傳SNP數(shù)據(jù)文件，或者是高通量測(cè)序文件便可以自動(dòng)完成包括生物信息學(xué)分析，基因組信息解讀（genomic interpretation），并最終呈現(xiàn)給用戶(hù)一份詳細(xì)的，用戶(hù)友好的，關(guān)于195種藥物反應(yīng)的基因檢測(cè)報(bào)告。

01.成果簡(jiǎn)介 CRISPR/Cas9是細(xì)菌在長(zhǎng)期演化過(guò)程中形成的一種適應(yīng)性免疫防御系統(tǒng)。其工作原理是crRNA通過(guò)堿基配對(duì)與tracrRNA結(jié)合形成tracrRNA/crRNA復(fù)合物，此復(fù)合物引導(dǎo)核酸酶cas9蛋白在與crRNA配對(duì)的序列靶位點(diǎn)剪切雙鏈DNA。經(jīng)過(guò)研究，通過(guò)人工設(shè)計(jì)tracrRNA/crRNA，改造形成具有引導(dǎo)作用的sgRNA，可以引導(dǎo)Cas9蛋白在多種細(xì)胞的特定基因組位點(diǎn)上進(jìn)行切割、修飾，并最終實(shí)現(xiàn)基因突變、插入或缺失。因此，CRISPR/Cas9系統(tǒng)已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于基因編輯技術(shù)領(lǐng)域。 近年來(lái)，CRISPR/Cas9基因編輯系統(tǒng)在真核生物和原核生物中得到了廣泛的應(yīng)用。在大腸桿菌等革蘭氏陰性菌中，用一個(gè)載體表達(dá)cas9基因，同時(shí)由于革蘭氏陰性菌重組效率低，需要在這個(gè)載體上表達(dá)λ-RED重組酶；在另一個(gè)載體中表達(dá)sgRNA和用于同源重組的同源臂序列。兩個(gè)載體都轉(zhuǎn)入大腸桿菌中時(shí)，sgRNA介導(dǎo)Cas9蛋白切割基因組上特定序列，形成雙鏈斷裂，刺激同源重組的發(fā)生，從而實(shí)現(xiàn)基因編輯。 本項(xiàng)成果構(gòu)建了適用于鹽單胞菌的基于CRISPR/Cas9的基因編輯系統(tǒng)。該系統(tǒng)由兩個(gè)載體組成：第一個(gè)載體表達(dá)Cas9基因，且不需要表達(dá)λ-RED重組酶，實(shí)際操作中不再需要誘導(dǎo)λ-RED重組酶的表達(dá)，簡(jiǎn)化了步驟流程；第二個(gè)載體表達(dá)sgRNA，并含有用于同源重組的同源臂序列。從而實(shí)現(xiàn)了基因編輯。本項(xiàng)成果的技術(shù)優(yōu)勢(shì)包括： （1）基因編輯時(shí)間由原有的20余天縮短到7-8天； （2）N個(gè)基因編輯時(shí)間由原有的N個(gè)月縮短到3+5N天； （3）無(wú)需表達(dá)λ-RED重組酶。                        圖1 鹽單胞菌TD01進(jìn)行基因編輯的流程示意圖02.應(yīng)用前景 本項(xiàng)成果可作為CRISPR/Cas9基因編輯系統(tǒng)的載體，廣泛應(yīng)用于基因編輯領(lǐng)域。03.知識(shí)產(chǎn)權(quán) 本項(xiàng)成果已申請(qǐng)1項(xiàng)發(fā)明專(zhuān)利。04.團(tuán)隊(duì)介紹 本項(xiàng)目為多團(tuán)隊(duì)合作項(xiàng)目，其中一個(gè)團(tuán)隊(duì)的負(fù)責(zé)人為清華大學(xué)教授，博士生導(dǎo)師，長(zhǎng)江學(xué)者特聘教授，國(guó)家杰出青年基金獲得者。主要研究方向?yàn)楹铣缮飳W(xué)、微生物代謝工程、生物材料、工業(yè)生物技術(shù)。已發(fā)表國(guó)內(nèi)外高水平學(xué)術(shù)論文數(shù)十篇，申請(qǐng)專(zhuān)利70余項(xiàng)。05.合作方式 投融資。06.聯(lián)系方式郵箱：zhangxinrui@tsinghua.edu.cn

一種家蠶滯育品種的低溫催青轉(zhuǎn)基因方法。用特殊的催青條件改變家蠶滯育品種下一代蠶卵的化性,使 特殊的催青條件下獲得的當(dāng)代家蠶滯育品種蠶蛾交配，產(chǎn)下非滯育的下一代蠶卵，最后參照非滯育家蠶卵胚 胎顯微注射的轉(zhuǎn)基因方法進(jìn)行轉(zhuǎn)基因，從而巧妙地突破家蠶滯育品種轉(zhuǎn)基因技術(shù)的障礙并有效制作轉(zhuǎn)基因 蠶。該方法直接采用生產(chǎn)中普遍使用的實(shí)用性家蠶滯育品種作為原始材料，可以避免漫長(zhǎng)而煩瑣的育種過(guò) 程，直接利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)創(chuàng)造出各種性狀優(yōu)良的新的特殊家蠶品種，可大大縮短育種的周期，節(jié)約大量的人 力和物力。一種家蠶滯育品種的早期浸酸轉(zhuǎn)基因方法，利用在蠶卵胚胎發(fā)育至胚帶形成之前的一定時(shí)間內(nèi)， 即產(chǎn)卵后2個(gè)半小時(shí)之前對(duì)家蠶滯育卵進(jìn)行鹽酸的浸泡處理,隨后對(duì)處理解除滯育的蠶卵進(jìn)行風(fēng)臺(tái)顯微注射， 催青孵化獲得的GO代家蠶的飼養(yǎng)至化蛾，它們的自交或回交產(chǎn)生G1代，通過(guò)熒光標(biāo)記篩選，從而有效制作 轉(zhuǎn)基因家蠶。該方法直接采用生產(chǎn)中普遍使用的實(shí)用性家蠶滯育品種作為原始材料，可以避免漫長(zhǎng)而煩瑣的 育種過(guò)程,直接利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)創(chuàng)造出各種性狀優(yōu)良的新的特殊家蠶品種，可大大縮短育種的周期，節(jié)約大 量的人力和物力。